Οι κύστεις των ωοθηκών είναι μικροί ή μεγαλύτεροι σάκοι γεμάτοι με υγρό που αναπτύσσονται πάνω ή μέσα στην ωοθήκη. Στη συντριπτική τους πλειονότητα, ιδιαίτερα σε νέες γυναίκες, είναι λειτουργικές κύστεις (όπως οι θυλακικές). Αυτό σημαίνει ότι σχετίζονται με τη φυσιολογική διαδικασία της ωορρηξίας και συνήθως υποχωρούν αυτόματα μέσα σε 1 έως 3 μήνες, καθώς το σώμα απορροφά το υγρό. Υπάρχουν όμως και άλλοι τύποι, όπως τα ενδομητριώματα ή οι δερμοειδείς κύστεις. Αν και συχνά είναι ασυμπτωματικές , αν μεγαλώσουν σημαντικά μπορεί να προκαλέσουν βάρος, πόνο ή, σε σπάνιες περιπτώσεις, επείγουσες καταστάσεις όπως η συστροφή της ωοθήκης. Η διάγνωση βασίζεται στον διακολπικό υπέρηχο και η θεραπεία κυμαίνεται από την απλή αναμονή έως τη χειρουργική αφαίρεση με σεβασμό στη γονιμότητα.